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《科学》刊发美国研究:纽约新冠病毒主要由欧洲和美洲

发布日期:2020-06-02 00:39   来源:未知   阅读:

最新研究显示,美国疫情最严重的地区??纽约的新冠病毒主要由欧洲和美洲多次独立引入。

以上结论来自美国西奈山卫生系统(Mount Sinai Health System)于当地时间5月29日刊发在国际权威期刊《科学》杂志上的研究。该研究题为《SARS-CoV-2在纽约市的引入及早期传播》(Introductions and early spread of SARS-CoV-2 in the New York City area)。

纽约市已成为当前SARS-CoV-2大流行的中心之一。为了确定病毒在纽约市区的早期快速传播事件,研究者对在西奈山卫生系统(Mount Sinai Health System)寻求治疗的新冠患者病毒进行了基因测序。对84个不同的SARS-CoV-2基因组的系统发育分析表明,纽约的新冠病毒主要来自欧洲和美国其他地区的多个相互独立的引入。此外,研究者还发现了SARS-CoV-2的社区传播证据,这与居住在城市不同社区的患者中发现的相关病毒群集有关。

新冠病毒(SARS-CoV-2)是一种新型病毒病原体,在过去几个月中新冠病毒在全球迅速蔓延,世界卫生组织(WHO)于2020年3月11日宣布大流行。美国于2月2日对中国、3月2日对伊朗、3月13日对欧洲大陆国家、3月16日对英国和爱尔兰实施了旅行限制,以防范国际输入病例。

尽管采取了这些措施,纽约州的第一例新冠确诊病例还是于2月29日出现在了纽约市。在3月的头几周,随着筛查能力的扩大,纽约新冠病例数迅速增加。截至5月2日,纽约州共有312977例新冠确诊病例,其中纽约市172354例(占纽约州55%)。纽约市已成为美国SARS-CoV-2感染的主要中心之一,其大都市地区超过13300人死亡。

位于西奈山伊坎医学院的病原体监测项目(PSP)是一个多学科、机构性的基础设施,旨在产生高分辨率、近乎实时的病原体遗传信息,这些病原体在来自那些在纽约西奈山卫生系统寻求治疗的大量、多样的患者。基于Illumina公司和Pacific Biosciences公司的新一代测序技术,通过生物pecimen编码、核酸提取和qPCR定量,PSP提供了病原体基因组的信息。